根據不同種類的燃料動力電池采用了不同的電解質，有酸性、堿性、熔融鹽類或固體電解質。在燃料動力電池中燃料與氧化劑經催化劑的用途，在能量轉換過程中，經過電化學反應生成電能和水(H2O)，因此，不會出現氮氧化物(NOX)和碳氫化合物(HC)等對大氣環境造成污染的氣體排放。燃料動力電池與普通蓄電池的差別在于：

1.燃料動力電池是一種能量轉換裝置，在工作時必須有能量(燃料)輸入，才能產出電能。普通蓄電池是一種能量儲存裝置，必須先將電能儲存到電池中，在工作時只能輸出電能，在工作時不要輸入能量，也不出現電能，這是燃料動力電池與普通電池本質的差別。

2.一旦燃料動力電池的技術性能確定后，其所能夠出現的電能只和燃料的供應有關，只要供給燃料就可以出現電能，其放電特性是持續進行的。普通蓄電池的技術性能確定后，只能在其額定范圍內輸出電能，而且必須是重復充電后才可能重復使用，其放電特性是間斷進行的。

3.燃料動力電池本體的質量和體積并不大，但燃料動力電池要一套燃料儲存裝置或燃料轉換裝置和附屬設備，才能獲得氫氣，而這些燃料儲存裝置或燃料轉換裝置和附屬設備的質量和體積遠遠超過燃料動力電池本身，在工作過程中，燃料會隨著燃料動力電池電能的出現逐漸消耗，質量逐漸減輕(指車載有限燃料)。普通蓄電池沒有其他輔助設備，在技術性能確定后，不論是充滿電還是放完電，蓄電池的質量和體積基本不變。